您好，具体要依据您相关操作规程进行操作，通常情况可以有以下几种方法，仅供参考：1.通知上游供货商冲销该发票，重新开具与实物相符的数量发票（同时随货同行单也要一致）致您方；2.如果已经入库，将货品在系统中做退货，同时将实际货品放置待验区，通知供货商补同批次货品，待货品到后，再进行入库；3.如果您方承担损失的话，可以直接全部入库，之后走盘亏流程，并说明亏损原因；此种方法不太符合收货时票账货款一致性的大原则。请您依据实际情况处理。