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连锁总部电商发货从批发公司仓库发货，回答问题一如下:不同省市不同政策，请依据当地药监部门管理要求执行。

（1）如果批发企业和连锁总部为同一法人，即集团化管理的模式的，可以配送公司仓库发货，质量有保证。

（2）如果不是同一集团化管理模式的，需要有质量协议或是合同，作为质量保证依据点。由配送公司仓库发货。

（3）以上两种情况均需要信息流走连锁门店。

问题二:是否允许电商发货由配送公司仓库发货均需要结合当地的政策要求而定。

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1、根据广东省药品监督管理局关于印发《广东省药品零售连锁经营监督管理办法》的通知本办法自2022年5月1日起施行。允许委托批发公司仓库发货，但需要签订《质量保证协议》。

2、信息流:销售及发货记录，其中包括冷链运输温度留存、财务结算，均需要经门店，这个过程涉及计算机系统，门店与总部系统对接，总部与被委托批发企业系统对接，具体信息流传输，详细需结合本企业系统设定而定。